2012年10月和2014年5月在诏安湾海域进行了鱼卵、仔稚鱼的调查，对诏安湾秋季和春季的鱼卵和仔稚鱼的种类组成、数量和分布进行了研究。结果表明，本调查海域共鉴定的鱼卵7种、仔稚鱼7种，隶属于10科10属；秋季共采集到鱼卵31个和仔稚鱼47尾，密集区出现在湾口的西屿北侧海域，春季共采集到鱼卵662个和仔稚鱼69尾，密集区主要分布在诏安湾中部偏北海域和湾口西屿西侧海域。秋季主要优势种为隆头鱼科鱼类、美肩鳃鮒，春季主要优势种为黄姑鱼、红鳍笛鲷和美肩鳃蹰。与东山湾相比，春季诏安湾鱼卵密度明显较大、仔稚鱼资源密度略低；秋季两个海湾的鱼卵、仔稚鱼数量均处于低水平；两个海湾的产卵时期主要在春季。

根据2012年在龙海市东南部海域进行的两个航次的单拖网调查，着重研究了该海域游泳生物的种类组成。结果表明，调查海域共出现游泳生物155种，其中鱼类种类数最多，为96 种；蟹类次之，有29 种；虾类22种；头足类8种。2012年8—9月的渔获物重量密度和尾数密度分别为868.00 kg/km2和134.51×103 ind./km2，远远大于2012年4月的资源密度176.12 kg/km2和22.12×103 ind./km2。渔获物重量和尾数密度物种多样性指数均值分别为3.30和3.26，处于较高水平。两个航次均出现的优势种有刀额仿对虾（Parapenaeopsis cultrirostris）和哈氏仿对虾（Parapenaeopsis hardwickii）。比较九龙江口的渔业资源调查资料，本调查海域游泳生物种类数较多、尾数密度均值较大、物种多样性较高。

根据2012—2013年在东山湾海域进行的4个季度航次的渔业资源调查资料，对该海域鱼卵、仔稚鱼及游泳动物组成特征进行了初步研究。结果表明，4个季度航次调查共鉴定出鱼卵15种，仔稚鱼8种（含5个未定种），鱼卵平均密度为2.63个/m3，仔稚鱼平均密度为0.50 ind/m3。共出现游泳动物269种，其中鱼类种类数最多，为202种；从季节分布来看，夏季游泳动物种类数最多（161种），冬季最少（62种）；从平面分布来看，夏季5号调查站位游泳动物种类数最多（95种），9号调查站位最少（12种）。本次调查，游泳动物重量资源密度平均值冬季最高（1 246.98 kg/km2），春季最低（372.68 kg/km2），尾数资源密度平均值春季最高（36.04×103 ind/km2），冬季最低（11.25×103 ind/km2）；四个季度月优势种均不同，表现出明显的季节更替现象；全年游泳动物重量密度多样性指数表现为秋季>夏季>春季>冬季，丰富度指数d均值为3.49，均匀度指数J'均值为0.64，单纯度指数C均值为0.23；全年游泳动物尾数密度多样性指数表现为夏季>冬季>春季>秋季，丰富度指数d均值为7.09，均匀度指数J'均值为0.70，单纯度指数C均值为0.18。与历史资料相比，本次调查鱼卵仔稚鱼密度四季均值较高，游泳动物种类数较多、重量和尾数密度四季均值较大、物种多样性较高。

八尺门海堤阻隔了东山湾与诏安湾的海水交换，导致海水水质和海洋生态环境日益恶化，因此漳州市政府决定实施八尺门海堤贯通工程。研究运用刘家驹平衡水深公式预测八尺门海域贯通后八尺门水道海底冲淤规律，研究东山湾与诏安湾海域的沉积动力特征，在此基础上，分析海堤拆除与清淤后对八尺门水道海域环境的影响。结果表明，海堤拆除并清淤后，八尺门水道及其附近海域水动力明显改变，表现为海水流速增大，水动力增强，其中贯通工程区域冲深深度约4 m，最终水深可达10.2 m ，贯通工程两侧冲深5～6 m，东西两侧口门段冲深1～2 m，冲淤环境逐渐变为侵蚀环境，并最终达到新的平衡，从而改变八尺门水道生态恶化的现状，有利于促进海洋资源可持续利用。